En 2015,au Japon.Grâce à une reprise de l 'économie et de la consommation,les rescapés du dernier cataclysme tentent de survivre dans la nouvelle ville forteresse de Tokyo-3.
Mais ce monde en pleine renaissance subit réguilerement les assauts inexpliqués de monstres appellés Anges.Seul la NERV peut les contrer grâce à leurs êtres organiques et cybernétiques controlés par des enfants:Les Evangelions